Con el propósito de dar un mejor manejo a la función de archivo de la justicia regional y con el ánimo de garantizar el derecho a la información y reprografía de la documentación, la Sala Administrativa del Consejo Superior de la Judicatura, mediante Acuerdo No. 2371 de 21 de abril de 2004 , adscribió al Centro de Documentación Socio Jurídica de la Rama Judicial – CENDOJ la Sección de Archivo de la extinta Justicia Regional, creada por Acuerdo No. 535 de 30 de junio de 1999

Con miras a fortalecer las actividades del Centro de Documentación Judicial-CENDOJ, mediante Acuerdo No. 2589 de 15 de septiembre 2004 se fijó una nueva estructura y planta de personal y se creó la Sección de Gestión Documental.

El Consejo Superior de la Judicatura, mediante Acuerdo PCSJA23-12107 del 02 de noviembre de 2023, creó el Centro de Memoria del Holocausto del Palacio de Justicia y del Derecho a la Vida que tiene como propósito honrar y exaltar la memoria de las víctimas que fallecieron en el Palacio de Justicia en Bogotá durante los trágicos eventos del 6 y 7 de noviembre de 1985, así como construir la memoria sobre el Holocausto y conservar el patrimonio documental de este.

Mediante Acuerdo PCSJA23-12131 del 29 de diciembre de 2023 se crea la División de Gestión Documental, Memoria Histórica y Archivo del CENDOJ y se establecen sus funciones, entre las que se destacan la planeación, coordinación y seguimiento del sistema de gestión documental y archivo de la Rama Judicial, la formulación de proyectos de actos administrativos, instrumentos técnicos, planes, programas y proyectos en esta materia, la preparación de propuestas para el desarrollo e incorporación de tecnologías para la administración de documentos, la administración funcional del sistema para la gestión de comunicaciones oficiales administrativas y del sistema de gestión de documentos electrónicos de archivo (SGDEA) de la Rama Judicial, la administración del Centro de Memoria del Holocausto del Palacio de Justicia y del Derecho a la Vida, la administración del archivo de la Justicia Regional, y la coordinación y realización de actividades de capacitación en materia de gestión documental.

En 2025, mediante Acuerdo PCSJA25-12272 se actualiza la Política de gestión documental y archivo para la Rama Judicial, constituida por el conjunto de principios, buenas prácticas, lineamientos, procesos y procedimientos, normas y tecnologías establecidas y que se establezcan a futuro para administrar los documentos y los expedientes en medios físicos y electrónicos, mediante una metodología general para su creación, uso, retención, acceso y preservación.